江苏省医学分子技术重点实验室2007年获江苏省科技厅批准建设，实验室依托单位为南京大学，挂靠于医学院，由南京大学医学院基础医学部、南京大学模式动物研究所和南京大学医学院附属鼓楼医院三方共建，总面积大于10000平米。实验室针对江苏地区高发的肿瘤、心脑血管和代谢性疾病诊治方面的迫切需求，从疾病临床表型分析入手，采用多种前沿技术，研究其相关基因和分子标志物，为建立重大疾病表型相似的动物模型、揭示其发生发展机制、筛查并鉴定具有应用潜能的重要功能分子奠定基础。将实验室建设成为国内一流的疾病功能分子研究基地，对我省相关研究领域发挥牵引和示范作用。首任实验室主任为王亚平教授，现任实验室主任为高千教授。2010年通过江苏省科技厅建设期验收，并获建设期绩效评估优秀。2011-2013年江苏省科技厅重点实验室绩效评估等级为良好，2014-2016年绩效评估等级为优秀，2017-2019年绩效评估为良好。

首任实验室主任王亚平教授

现任实验室主任高千教授